Процесс исследования включает три этапа:
- извлечение ДНК из биологического материала. Это критически важный шаг, для которого используются коммерческие наборы реактивов от ведущих зарубежных производителей, таких как Applied Biosystems (США), Promega (США), QIAGEN (Германия).
- увеличение числа исследуемых локусов ДНК с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР).
- анализ полиморфизмов длины фрагментов, полученных после ПЦР, с использованием капиллярного электрофореза и/или определение первичной последовательности нуклеотидов с помощью секвенирования.
Для повышения точности экспертизы важно учитывать степень родства, количество участников исследования и число анализируемых маркеров. Рекомендуется тестировать более двух человек, предположительно состоящих в родстве. Например, в экспертизе "внук-бабушка" вероятность положительного заключения превышает 90%, отрицательного — около 85%. В случае анализа "внук-бабушка-дедушка" вероятность положительного заключения возрастает до 99%, а отрицательного — до 100%.
Генетические маркеры, используемые для проведения экспертизы по установлению близкого родства, могут включать в себя:
- аутосомные локусы. Аутосомы — это парные хромосомы, которые идентичны как у мужчин, так и у женщин. Это все хромосомы, кроме половых (X- и Y-хромосом). Генетические маркеры на аутосомах (аутосомные локусы) чаще всего применяются в экспертизе для определения близкого родства. Для этих целей разработаны коммерческие наборы реактивов от ведущих мировых производителей.
- STR-локусы Y-хромосомы. Y-хромосома — половая хромосома, отвечающая за определение мужского пола. Она непарная, не рекомбинирует в мейозе и передается от отца к сыну в почти неизменном виде. Рекомендуется использовать 22 полиморфных локуса из базы данных Y-chromosome Haplotype Reference Database. Мы также подготовили статью, посвящённую анализу ДНК Y-хромосомы, озаглавленную «Генетическая экспертиза Y-хромосомы (тест семейной принадлежности)».
- STR-локусы X-хромосомы. X-хромосома — половая хромосома, отвечающая за определение женского пола. Женские клетки содержат две X-хромосомы, тогда как мужские — только одну. Поэтому в мужских клетках X-хромосома почти не рекомбинирует и передается детям без изменений. Компания QIAGEN предлагает набор Investigator Argus X-12 Kit для картирования локусов на X-хромосоме.
- нуклеотидный профиль митохондриальной ДНК (мтДНК). Мы также подготовили статью «Генетическая экспертиза митохондриальной ДНК (мтДНК)», которую можно изучить для получения дополнительной информации.
Во время экспертизы исследуются локусы ДНК, которые по мужской или женской линии передались от предполагаемого родственника. Для установления родства по отцовской линии используются либо аутосомные локусы, либо локусы на Y-хромосоме. Типирование по Y- и X-хромосомам применяется для установления отцовских родственных связей, например, "дед по отцу - внук", "дядя по отцу — племянник", "братья по отцу". По X-хромосоме определяются связи "бабушка по отцу — внучка", "тётя по отцу — племянница", "сестра по отцу". Для установления родства по материнской линии используют аутосомные локусы или анализируют профиль митохондриальной ДНК.